A APAE Escola, atualmente contempla o Ensino Fundamental I e EJA - Educação de Jovens e Adultos com currículos adaptados para educação especial, AEE (Atendimento Educacional Especializado) oferecendo suporte aos alunos que foram incluídos as escolas de ensino comum
O programa oferece também atendimentos especializados na casa funcional, auto defensoria,música e educação física